鶯歌的發展雖然和陶瓷密不可分，但日治時期將鐵路由新莊、龜山改由板橋、鶯歌接往桃園，也是造就鶯歌繁榮的另個重要因素，時至今日，火車早已成為三鶯地區最重要的聯外交通工具。

　清代劉銘傳興建的縱貫線並未經過鶯歌，從西川滿的《台灣縱貫鐵道》及其他史料可以發現，日軍乙未年自澳底登陸後，隨即進軍基隆，並沿著縱貫線進入台北城時，發現清代鐵路凹凸不平、急彎陡坡隨處可見，西川滿的《台灣縱貫鐵道》就寫著，爬不上坡時甚至連乘客得趕緊下車減輕重量，為此總督府除計畫闢建縱貫鐵路，同時也開始計劃著手改良清代鐵道路線。

台灣文學館收藏的1978年版《台灣縱貫鐵道》，本書也是殖民時期在台日人三大長篇小說巨著之一

　日人針對清代縱貫線鐵道的改進處，除了廢棄獅球嶺隧道，改築竹仔嶺隧道外，另個重大的變更，就是把原本由大橋頭、新莊接往龜崙嶺的鐵道，改由艋舺、板橋、鶯歌接往桃園，這也是縱貫鐵路的第一次大改道。

　結果，清代開鑿的獅球嶺隧道，只使用七年多（1890-1898）就被日本人廢止；大橋頭到龜崙嶺這段鐵道，也在明治三十四年（1901）八月二十五日起改道板橋、鶯歌。

清代興築的縱貫鐵路龜崙嶺鐵道，在日治初期路線改由板橋經鶯歌通往桃園後廢止

原野三重唱演唱的《板橋查某》

　改道的原因除了因為坡度陡運能效率不佳，民間也傳說，板橋林家的影響力，也是促成改道的另個因素。這次鐵路改道造成新莊廢站、板橋通車，傳說也是造成「板橋查某」這首歌謠傳唱一時的幕後原因。

　其實，台北是個盆地，但桃園卻是地勢較高的台地，無論鐵道路線怎麼變更，「坡度」問題依舊無法迴避。大正八（1919）年6月21日上午，鶯歌石至桃仔園間鐵道因坡度過陡，發生列車倒退衝進鶯歌石驛月台造成13人死亡的重大意外，這也是台灣鐵道史上首次重大傷亡車禍，在此之前也是車禍事故意外頻傳。

　一般來說，千分之零至千分之四的坡度叫作輕坡度；千分之四至千分之十為中坡度；千分之十至千分之二十為重坡度；千分之二十以上就叫作超大坡度，通常不宜興建鐵路，舊山線的三義至勝興間有全台最大陡坡千分之二十六，不利運輸，日治時期才會另闢海線鐵道。

總督府鐵道部變更鶯歌石庄內的路線，將新路線上的無主孤墳遷至中正二路的萬應公

台鐵在尖山埔路陶瓷老街口的鐵道旁設有上升坡度千分之11.4的標誌，鶯歌坡算是縱貫線陡坡之一

　車禍發生後，總督府鐵道部也變更路線設計，把原本位在今鶯歌分駐所前方的車站改制現址，並改變策略將鐵道路線「盤山展線」，將原本走中山路的鐵道，改從「十一間仔」的陶瓷老街外頭經由尖山地區多繞行市區外圍一大圈，藉以拉長距離把坡度降緩至約千分之十，以防意外再度發生，並於大正十一（1922）年五月十六日把原本位在鶯歌分駐所前的站房，遷移至文化路現址的新站房，這也是縱貫鐵路第二次大改道。

　雖然鐵路發生大車禍，但同一年桃園大圳開鑿完成使水量驟減五分之四，原本為大漢溪行水區的陶博館至三峽恩主公醫院一帶，也因水量驟減而成河川地，造成航運失利，鶯歌庄十五石容量帆船剩15艘，原本從艋舺可以一路直上大溪的帆船，也逐漸從二甲九的碼頭消失，鶯歌也正式成為以火車、陸運為主的都市。